A.D.1999，由墜落地球的“謎之戰艦”(之后被稱之為Macross)帶來的Over Technology(オーバーテクノロジー)，揭示了人類歷史和遠古文明 Proto Culture (プロトカルチャー)之間的絲絲聯系。促使人類終止彼此間的戰爭，一方面面對強大的異星人勢力 Zentraedi(ゼントラーディ)和Proto Deviln(プロトデビルン)，用“文化的力量”尋找生存之道，一方面向著銀河系進行移民而尋求新天地。最初的Macross，被看作改變了地球宇宙歷史的“命運之船”！西元1999年，一顆不明的巨大「流星」墜落在地球..